Protein–RNA interactions for Protein: O76070

SNCG, Gamma-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCGO76070 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCGO76070 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCGO76070 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCGO76070 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCGO76070 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNCGO76070 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNCGO76070 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNCGO76070 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNCGO76070 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNCGO76070 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNCGO76070 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNCGO76070 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNCGO76070 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNCGO76070 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNCGO76070 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNCGO76070 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNCGO76070 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNCGO76070 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNCGO76070 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNCGO76070 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNCGO76070 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNCGO76070 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNCGO76070 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNCGO76070 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SNCGO76070 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNCGO76070 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNCGO76070 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNCGO76070 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNCGO76070 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNCGO76070 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNCGO76070 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNCGO76070 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNCGO76070 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNCGO76070 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNCGO76070 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNCGO76070 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNCGO76070 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNCGO76070 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNCGO76070 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNCGO76070 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNCGO76070 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNCGO76070 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNCGO76070 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNCGO76070 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNCGO76070 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNCGO76070 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNCGO76070 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNCGO76070 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNCGO76070 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNCGO76070 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNCGO76070 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNCGO76070 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNCGO76070 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SNCGO76070 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SNCGO76070 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SNCGO76070 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SNCGO76070 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNCGO76070 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNCGO76070 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNCGO76070 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNCGO76070 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNCGO76070 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNCGO76070 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNCGO76070 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNCGO76070 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNCGO76070 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNCGO76070 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNCGO76070 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNCGO76070 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNCGO76070 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNCGO76070 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNCGO76070 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNCGO76070 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNCGO76070 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNCGO76070 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNCGO76070 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SNCGO76070 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNCGO76070 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNCGO76070 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNCGO76070 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNCGO76070 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNCGO76070 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNCGO76070 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNCGO76070 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNCGO76070 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNCGO76070 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNCGO76070 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNCGO76070 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNCGO76070 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SNCGO76070 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNCGO76070 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNCGO76070 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNCGO76070 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNCGO76070 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNCGO76070 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNCGO76070 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNCGO76070 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNCGO76070 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNCGO76070 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNCGO76070 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms