Protein–RNA interactions for Protein: O75678

RFPL2, Ret finger protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL2O75678 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFPL2O75678 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFPL2O75678 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFPL2O75678 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFPL2O75678 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFPL2O75678 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFPL2O75678 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFPL2O75678 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFPL2O75678 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFPL2O75678 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms