Protein–RNA interactions for Protein: O75564

JRK, Jerky protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JRKO75564 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
JRKO75564 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
JRKO75564 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
JRKO75564 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
JRKO75564 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
JRKO75564 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
JRKO75564 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
JRKO75564 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
JRKO75564 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
JRKO75564 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
JRKO75564 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
JRKO75564 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
JRKO75564 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
JRKO75564 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
JRKO75564 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
JRKO75564 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
JRKO75564 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
JRKO75564 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
JRKO75564 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
JRKO75564 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
JRKO75564 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
JRKO75564 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
JRKO75564 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
JRKO75564 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
JRKO75564 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
JRKO75564 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
JRKO75564 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
JRKO75564 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
JRKO75564 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
JRKO75564 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
JRKO75564 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
JRKO75564 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
JRKO75564 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
JRKO75564 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
JRKO75564 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
JRKO75564 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
JRKO75564 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
JRKO75564 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
JRKO75564 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
JRKO75564 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
JRKO75564 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
JRKO75564 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
JRKO75564 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
JRKO75564 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
JRKO75564 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
JRKO75564 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
JRKO75564 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
JRKO75564 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
JRKO75564 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
JRKO75564 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
JRKO75564 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
JRKO75564 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
JRKO75564 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
JRKO75564 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
JRKO75564 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
JRKO75564 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
JRKO75564 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
JRKO75564 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
JRKO75564 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
JRKO75564 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
JRKO75564 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
JRKO75564 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
JRKO75564 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
JRKO75564 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
JRKO75564 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
JRKO75564 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
JRKO75564 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
JRKO75564 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
JRKO75564 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
JRKO75564 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
JRKO75564 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
JRKO75564 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
JRKO75564 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
JRKO75564 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
JRKO75564 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
JRKO75564 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
JRKO75564 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
JRKO75564 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
JRKO75564 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
JRKO75564 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
JRKO75564 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
JRKO75564 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
JRKO75564 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
JRKO75564 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
JRKO75564 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
JRKO75564 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
JRKO75564 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
JRKO75564 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
JRKO75564 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
JRKO75564 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
JRKO75564 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
JRKO75564 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
JRKO75564 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
JRKO75564 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
JRKO75564 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
JRKO75564 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
JRKO75564 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
JRKO75564 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
JRKO75564 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
JRKO75564 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms