Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SKAP2O75563 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms