Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 MCCC1-213ENST00000497959 2874 ntTSL 28.36□□□□□ -1.072e-7■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 DAZAP2-208ENST00000549555 872 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.082e-7■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 SELENOF-204ENST00000467557 499 ntTSL 58.29□□□□□ -1.081e-14■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 ARNT-209ENST00000505979 570 ntTSL 28.26□□□□□ -1.096e-9■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.242e-7■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.53e-10■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 DAZAP2-213ENST00000552173 539 ntTSL 45.11□□□□□ -1.592e-7■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 MRE11-207ENST00000536754 572 ntTSL 44.97□□□□□ -1.613e-10■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.682e-7■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.692e-7■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 XPOT-205ENST00000541842 523 ntTSL 24.17□□□□□ -1.743e-10■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 DAZAP2-206ENST00000549041 598 ntTSL 21.73□□□□□ -2.132e-7■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 SLC12A7-206ENST00000634447 3142 ntTSL 513.95□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 180.8
SF3B1O75533 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 180.7
SF3B1O75533 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.242e-6■■■■■ 180.7
SF3B1O75533 PKP4-203ENST00000411900 552 ntTSL 411.04□□□□□ -0.641e-6■■■■■ 180.6
SF3B1O75533 PKP4-208ENST00000462335 561 ntTSL 410.4□□□□□ -0.741e-6■■■■■ 180.6
SF3B1O75533 FLJ46284-203ENST00000521230 407 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -14e-6■■■■■ 180.6
SF3B1O75533 FLJ46284-202ENST00000521148 496 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.14e-6■■■■■ 180.6
SF3B1O75533 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.332e-11■■■■■ 180.5
SF3B1O75533 EDC3-217ENST00000569606 533 ntTSL 213.35□□□□□ -0.273e-12■■■■■ 180.5
SF3B1O75533 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.322e-11■■■■■ 180.5
SF3B1O75533 ACSL4-204ENST00000469796 5225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.172e-11■■■■■ 180.5
SF3B1O75533 CAPN15-208ENST00000637507 1482 ntTSL 523.97■■□□□ 1.433e-10■■■■■ 180.1
SF3B1O75533 MAD1L1-212ENST00000450235 850 ntTSL 318.75■□□□□ 0.595e-7■■■■■ 180.1
SF3B1O75533 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.053e-7■■■■■ 180
SF3B1O75533 AC022384.1-202ENST00000450534 2831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.413e-7■■■■■ 180
SF3B1O75533 AC022384.1-201ENST00000437082 2270 ntAPPRIS P5 TSL 211.52□□□□□ -0.563e-7■■■■■ 180
SF3B1O75533 TATDN2-203ENST00000448281 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.753e-7■■■■■ 180
SF3B1O75533 QARS-205ENST00000430182 2399 ntTSL 212.98□□□□□ -0.334e-6■■■■■ 179.8
SF3B1O75533 QARS-251ENST00000637543 2074 ntTSL 512.72□□□□□ -0.374e-6■■■■■ 179.8
SF3B1O75533 QARS-202ENST00000414533 2412 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.384e-6■■■■■ 179.8
SF3B1O75533 QARS-248ENST00000636669 2410 ntTSL 512.6□□□□□ -0.394e-6■■■■■ 179.8
SF3B1O75533 QARS-209ENST00000464962 2362 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.564e-6■■■■■ 179.8
SF3B1O75533 QARS-247ENST00000636018 2171 ntTSL 511.04□□□□□ -0.644e-6■■■■■ 179.8
SF3B1O75533 QARS-201ENST00000306125 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.684e-6■■■■■ 179.8
SF3B1O75533 MED12-203ENST00000374102 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.592e-7■■■■■ 179.8
SF3B1O75533 MED12-201ENST00000333646 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.82e-7■■■■■ 179.8
SF3B1O75533 MED12-202ENST00000374080 6795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.962e-7■■■■■ 179.8
SF3B1O75533 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.811e-6■■■■■ 179.4
SF3B1O75533 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 179.4
SF3B1O75533 KAZN-206ENST00000491547 5592 ntTSL 218.64■□□□□ 0.581e-6■■■■■ 179.4
SF3B1O75533 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.471e-6■■■■■ 179.4
SF3B1O75533 SPG7-204ENST00000561911 1025 ntTSL 516.9■□□□□ 0.33e-6■■■■■ 179.2
SF3B1O75533 SPG7-222ENST00000569820 2305 ntTSL 512.25□□□□□ -0.453e-6■■■■■ 179.2
SF3B1O75533 TRIP12-203ENST00000389044 6405 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.633e-6■■■■■ 179
SF3B1O75533 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.33e-6■■■■■ 179
SF3B1O75533 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.453e-6■■■■■ 179
SF3B1O75533 CTTN-210ENST00000525852 1470 ntTSL 513.35□□□□□ -0.273e-6■■■■■ 178.9
SF3B1O75533 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.495e-7■■■■■ 178.7
SF3B1O75533 UBXN7-206ENST00000493566 921 ntTSL 1 (best)20.91■□□□□ 0.944e-6■■■■■ 178.7
SF3B1O75533 AC020915.6-202ENST00000637310 1463 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.22□□□□□ -0.293e-6■■■■■ 178.7
SF3B1O75533 AC020915.6-201ENST00000637233 3042 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.583e-6■■■■■ 178.7
SF3B1O75533 OSBPL5-212ENST00000528124 567 ntTSL 420.32■□□□□ 0.843e-6■■■■■ 178.5
SF3B1O75533 DOCK8-204ENST00000432829 7452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.062e-6■■■■■ 178.4
SF3B1O75533 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.113e-6■■■■■ 178.3
SF3B1O75533 C15orf41-214ENST00000569302 1325 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.993e-6■■■■■ 178.3
SF3B1O75533 C15orf41-202ENST00000437989 2240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.133e-6■■■■■ 178.3
SF3B1O75533 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.413e-6■■■■■ 178.3
SF3B1O75533 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.643e-6■■■■■ 178.3
SF3B1O75533 KLHL24-203ENST00000437402 563 ntTSL 524.24■■□□□ 1.478e-10■■■■■ 178.1
SF3B1O75533 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.435e-9■■■■■ 178.1
SF3B1O75533 KLHL24-213ENST00000482138 588 ntTSL 422.88■■□□□ 1.258e-10■■■■■ 178.1
SF3B1O75533 KLHL24-215ENST00000493074 627 ntTSL 422.88■■□□□ 1.258e-10■■■■■ 178.1
SF3B1O75533 KLHL24-204ENST00000454495 603 ntTSL 322.46■■□□□ 1.198e-10■■■■■ 178.1
SF3B1O75533 KLHL24-202ENST00000427201 562 ntTSL 421.55■■□□□ 1.048e-10■■■■■ 178.1
SF3B1O75533 KLHL24-209ENST00000473045 542 ntTSL 420.72■□□□□ 0.918e-10■■■■■ 178.1
SF3B1O75533 KLHL24-207ENST00000468001 613 ntTSL 319.6■□□□□ 0.738e-10■■■■■ 178.1
SF3B1O75533 KLHL24-208ENST00000468101 574 ntTSL 419.42■□□□□ 0.78e-10■■■■■ 178.1
SF3B1O75533 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.15e-9■■■■■ 178.1
SF3B1O75533 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.235e-9■■■■■ 178.1
SF3B1O75533 BAZ2A-210ENST00000549787 2773 ntTSL 1 (best)12.63□□□□□ -0.392e-7■■■■■ 178.1
SF3B1O75533 SGK494-202ENST00000461399 673 ntTSL 511.2□□□□□ -0.625e-8■■■■■ 178.1
SF3B1O75533 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.182e-7■■■■■ 178
SF3B1O75533 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.782e-6■■■■■ 177.8
SF3B1O75533 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.872e-6■■■■■ 177.8
SF3B1O75533 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.732e-6■■■■■ 177.7
SF3B1O75533 RAD23B-203ENST00000419616 716 ntTSL 320.76■□□□□ 0.912e-6■■■■■ 177.4
SF3B1O75533 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 177.4
SF3B1O75533 TTC38-203ENST00000421359 821 ntTSL 417.27■□□□□ 0.367e-8■■■■■ 177.3
SF3B1O75533 CCDC57-207ENST00000419322 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.38■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 177.3
SF3B1O75533 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.117e-8■■■■■ 177.3
SF3B1O75533 SUPT5H-201ENST00000359191 3770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.59e-7■■■■■ 177.1
SF3B1O75533 SUPT5H-203ENST00000402194 3698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.539e-7■■■■■ 177.1
SF3B1O75533 SUPT5H-204ENST00000432763 3710 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.569e-7■■■■■ 177.1
SF3B1O75533 SUPT5H-215ENST00000599117 3902 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.69e-7■■■■■ 177.1
SF3B1O75533 SUPT5H-213ENST00000598725 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.639e-7■■■■■ 177.1
SF3B1O75533 UQCC1-213ENST00000453855 1035 ntTSL 415.19■□□□□ 0.024e-8■■■■■ 177.1
SF3B1O75533 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.084e-8■■■■■ 177.1
SF3B1O75533 UQCC1-210ENST00000424405 758 ntTSL 513.96□□□□□ -0.174e-8■■■■■ 177.1
SF3B1O75533 UQCC1-214ENST00000457259 1987 ntTSL 1 (best)13.01□□□□□ -0.334e-8■■■■■ 177.1
SF3B1O75533 UQCC1-206ENST00000374394 2329 ntTSL 212.55□□□□□ -0.44e-8■■■■■ 177.1
SF3B1O75533 UQCC1-203ENST00000374380 2133 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.464e-8■■■■■ 177.1
SF3B1O75533 UQCC1-201ENST00000349714 2188 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.494e-8■■■■■ 177.1
SF3B1O75533 UQCC1-202ENST00000359226 2036 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.54e-8■■■■■ 177.1
SF3B1O75533 UQCC1-205ENST00000374385 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.684e-8■■■■■ 177.1
SF3B1O75533 APPL2-215ENST00000553097 514 ntTSL 411.52□□□□□ -0.573e-9■■■■■ 176.9
SF3B1O75533 APPL2-204ENST00000546768 637 ntTSL 310.55□□□□□ -0.723e-9■■■■■ 176.9
SF3B1O75533 APPL2-209ENST00000549056 493 ntTSL 54.62□□□□□ -1.673e-9■■■■■ 176.9
SF3B1O75533 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.471e-6■■■■■ 176.6
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 289.2 ms