Protein–RNA interactions for Protein: O75531

BANF1, Barrier-to-autointegration factor, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BANF1O75531 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BANF1O75531 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BANF1O75531 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BANF1O75531 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BANF1O75531 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BANF1O75531 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BANF1O75531 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BANF1O75531 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BANF1O75531 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BANF1O75531 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BANF1O75531 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BANF1O75531 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BANF1O75531 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BANF1O75531 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BANF1O75531 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BANF1O75531 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BANF1O75531 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BANF1O75531 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BANF1O75531 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BANF1O75531 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BANF1O75531 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BANF1O75531 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BANF1O75531 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BANF1O75531 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BANF1O75531 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BANF1O75531 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BANF1O75531 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BANF1O75531 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BANF1O75531 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BANF1O75531 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BANF1O75531 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BANF1O75531 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BANF1O75531 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BANF1O75531 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BANF1O75531 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BANF1O75531 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BANF1O75531 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BANF1O75531 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BANF1O75531 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BANF1O75531 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BANF1O75531 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BANF1O75531 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BANF1O75531 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BANF1O75531 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BANF1O75531 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BANF1O75531 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BANF1O75531 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BANF1O75531 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BANF1O75531 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BANF1O75531 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BANF1O75531 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BANF1O75531 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BANF1O75531 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BANF1O75531 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BANF1O75531 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BANF1O75531 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BANF1O75531 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BANF1O75531 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BANF1O75531 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BANF1O75531 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BANF1O75531 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BANF1O75531 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BANF1O75531 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BANF1O75531 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BANF1O75531 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BANF1O75531 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BANF1O75531 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BANF1O75531 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BANF1O75531 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BANF1O75531 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BANF1O75531 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BANF1O75531 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BANF1O75531 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BANF1O75531 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BANF1O75531 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BANF1O75531 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BANF1O75531 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BANF1O75531 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BANF1O75531 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BANF1O75531 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BANF1O75531 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BANF1O75531 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BANF1O75531 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BANF1O75531 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BANF1O75531 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BANF1O75531 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BANF1O75531 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BANF1O75531 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BANF1O75531 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BANF1O75531 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BANF1O75531 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BANF1O75531 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BANF1O75531 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BANF1O75531 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BANF1O75531 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BANF1O75531 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BANF1O75531 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BANF1O75531 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BANF1O75531 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BANF1O75531 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms