Protein–RNA interactions for Protein: O75503

CLN5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5O75503 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN5O75503 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN5O75503 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN5O75503 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN5O75503 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN5O75503 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN5O75503 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN5O75503 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN5O75503 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN5O75503 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN5O75503 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN5O75503 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN5O75503 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN5O75503 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN5O75503 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN5O75503 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN5O75503 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN5O75503 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN5O75503 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN5O75503 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN5O75503 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN5O75503 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN5O75503 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN5O75503 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN5O75503 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN5O75503 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN5O75503 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN5O75503 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN5O75503 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN5O75503 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN5O75503 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN5O75503 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN5O75503 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN5O75503 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN5O75503 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN5O75503 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN5O75503 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN5O75503 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN5O75503 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN5O75503 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN5O75503 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN5O75503 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN5O75503 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN5O75503 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN5O75503 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN5O75503 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN5O75503 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN5O75503 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN5O75503 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN5O75503 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN5O75503 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN5O75503 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN5O75503 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN5O75503 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN5O75503 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN5O75503 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN5O75503 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN5O75503 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN5O75503 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN5O75503 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN5O75503 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN5O75503 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLN5O75503 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLN5O75503 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLN5O75503 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLN5O75503 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLN5O75503 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLN5O75503 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLN5O75503 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLN5O75503 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN5O75503 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN5O75503 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN5O75503 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN5O75503 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN5O75503 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN5O75503 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN5O75503 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN5O75503 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN5O75503 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN5O75503 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN5O75503 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN5O75503 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLN5O75503 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CLN5O75503 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN5O75503 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN5O75503 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLN5O75503 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLN5O75503 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN5O75503 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLN5O75503 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN5O75503 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN5O75503 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN5O75503 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN5O75503 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN5O75503 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN5O75503 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN5O75503 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN5O75503 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN5O75503 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN5O75503 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms