Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
VAMP4O75379 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
VAMP4O75379 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
VAMP4O75379 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
VAMP4O75379 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VAMP4O75379 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VAMP4O75379 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
VAMP4O75379 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VAMP4O75379 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
VAMP4O75379 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VAMP4O75379 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
VAMP4O75379 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
VAMP4O75379 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VAMP4O75379 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
VAMP4O75379 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
VAMP4O75379 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
VAMP4O75379 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms