Protein–RNA interactions for Protein: O75063

FAM20B, Glycosaminoglycan xylosylkinase, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20BO75063 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM20BO75063 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM20BO75063 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM20BO75063 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM20BO75063 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM20BO75063 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM20BO75063 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM20BO75063 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM20BO75063 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM20BO75063 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM20BO75063 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM20BO75063 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM20BO75063 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM20BO75063 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM20BO75063 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM20BO75063 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM20BO75063 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM20BO75063 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM20BO75063 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM20BO75063 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM20BO75063 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM20BO75063 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM20BO75063 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM20BO75063 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM20BO75063 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM20BO75063 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM20BO75063 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM20BO75063 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM20BO75063 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM20BO75063 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM20BO75063 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM20BO75063 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM20BO75063 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM20BO75063 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM20BO75063 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM20BO75063 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms