Protein–RNA interactions for Protein: O60936

NOL3, Nucleolar protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOL3O60936 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NOL3O60936 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NOL3O60936 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOL3O60936 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOL3O60936 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOL3O60936 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOL3O60936 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOL3O60936 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NOL3O60936 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOL3O60936 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NOL3O60936 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOL3O60936 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOL3O60936 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOL3O60936 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOL3O60936 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOL3O60936 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOL3O60936 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOL3O60936 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOL3O60936 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOL3O60936 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOL3O60936 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NOL3O60936 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NOL3O60936 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOL3O60936 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOL3O60936 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOL3O60936 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOL3O60936 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOL3O60936 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOL3O60936 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOL3O60936 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOL3O60936 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOL3O60936 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOL3O60936 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOL3O60936 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NOL3O60936 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NOL3O60936 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NOL3O60936 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NOL3O60936 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NOL3O60936 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NOL3O60936 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NOL3O60936 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NOL3O60936 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NOL3O60936 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NOL3O60936 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NOL3O60936 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NOL3O60936 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NOL3O60936 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NOL3O60936 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NOL3O60936 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NOL3O60936 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NOL3O60936 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NOL3O60936 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NOL3O60936 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NOL3O60936 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NOL3O60936 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NOL3O60936 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NOL3O60936 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NOL3O60936 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NOL3O60936 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NOL3O60936 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NOL3O60936 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NOL3O60936 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NOL3O60936 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NOL3O60936 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NOL3O60936 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NOL3O60936 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NOL3O60936 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NOL3O60936 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NOL3O60936 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NOL3O60936 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NOL3O60936 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NOL3O60936 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NOL3O60936 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NOL3O60936 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NOL3O60936 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NOL3O60936 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NOL3O60936 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NOL3O60936 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NOL3O60936 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NOL3O60936 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NOL3O60936 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NOL3O60936 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NOL3O60936 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NOL3O60936 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NOL3O60936 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NOL3O60936 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NOL3O60936 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NOL3O60936 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NOL3O60936 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NOL3O60936 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NOL3O60936 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NOL3O60936 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NOL3O60936 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NOL3O60936 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NOL3O60936 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NOL3O60936 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NOL3O60936 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NOL3O60936 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NOL3O60936 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NOL3O60936 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms