Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOBOXO60393 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOBOXO60393 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms