Protein–RNA interactions for Protein: O43933

PEX1, Peroxisome biogenesis factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX1O43933 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX1O43933 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX1O43933 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX1O43933 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX1O43933 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX1O43933 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX1O43933 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX1O43933 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX1O43933 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX1O43933 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX1O43933 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX1O43933 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX1O43933 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX1O43933 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX1O43933 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX1O43933 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX1O43933 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX1O43933 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX1O43933 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX1O43933 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PEX1O43933 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PEX1O43933 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PEX1O43933 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PEX1O43933 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PEX1O43933 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PEX1O43933 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PEX1O43933 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PEX1O43933 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PEX1O43933 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PEX1O43933 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PEX1O43933 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PEX1O43933 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX1O43933 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX1O43933 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX1O43933 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX1O43933 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX1O43933 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX1O43933 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX1O43933 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX1O43933 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX1O43933 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX1O43933 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX1O43933 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX1O43933 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX1O43933 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX1O43933 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX1O43933 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX1O43933 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX1O43933 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX1O43933 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX1O43933 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX1O43933 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX1O43933 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX1O43933 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX1O43933 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX1O43933 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX1O43933 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX1O43933 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX1O43933 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX1O43933 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX1O43933 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX1O43933 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX1O43933 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX1O43933 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX1O43933 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX1O43933 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX1O43933 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX1O43933 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX1O43933 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX1O43933 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX1O43933 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX1O43933 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX1O43933 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX1O43933 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX1O43933 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX1O43933 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX1O43933 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX1O43933 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX1O43933 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX1O43933 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX1O43933 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX1O43933 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX1O43933 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX1O43933 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX1O43933 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX1O43933 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX1O43933 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX1O43933 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX1O43933 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX1O43933 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX1O43933 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX1O43933 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX1O43933 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX1O43933 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX1O43933 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX1O43933 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX1O43933 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX1O43933 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PEX1O43933 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PEX1O43933 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms