Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXTL3O43909 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EXTL3O43909 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms