Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms