Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms