Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPAA1O43292 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPAA1O43292 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPAA1O43292 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
GPAA1O43292 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPAA1O43292 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPAA1O43292 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPAA1O43292 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPAA1O43292 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPAA1O43292 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPAA1O43292 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPAA1O43292 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPAA1O43292 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPAA1O43292 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPAA1O43292 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPAA1O43292 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GPAA1O43292 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPAA1O43292 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPAA1O43292 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPAA1O43292 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPAA1O43292 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPAA1O43292 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPAA1O43292 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPAA1O43292 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPAA1O43292 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPAA1O43292 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPAA1O43292 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPAA1O43292 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPAA1O43292 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPAA1O43292 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPAA1O43292 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPAA1O43292 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPAA1O43292 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPAA1O43292 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPAA1O43292 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
GPAA1O43292 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPAA1O43292 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
GPAA1O43292 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPAA1O43292 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPAA1O43292 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GPAA1O43292 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GPAA1O43292 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms