Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 BCLAF1-224ENST00000640069 7719 ntTSL 51.15□□□□□ -2.233e-9■■■■■ 30.4
RBFOX2O43251 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.429e-7■■■■■ 30.4
RBFOX2O43251 NOC2L-205ENST00000487214 865 ntTSL 314.71□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 30.4
RBFOX2O43251 LRRFIP1-207ENST00000465870 1626 ntTSL 312.44□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 30.4
RBFOX2O43251 FOXN3-211ENST00000555855 851 ntTSL 514.34□□□□□ -0.113e-7■■■■■ 30.4
RBFOX2O43251 VPS13B-206ENST00000496144 5625 ntTSL 56.84□□□□□ -1.312e-6■■■■■ 30.4
RBFOX2O43251 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.492e-6■■■■■ 30.4
RBFOX2O43251 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.582e-6■■■■■ 30.4
RBFOX2O43251 PPP2R3B-210ENST00000496630 458 ntTSL 214.55□□□□□ -0.083e-7■■■■■ 30.3
RBFOX2O43251 EML3-218ENST00000533165 524 ntTSL 39.51□□□□□ -0.894e-11■■■■■ 30.3
RBFOX2O43251 XAB2-202ENST00000595288 4555 ntTSL 213.09□□□□□ -0.314e-8■■■■■ 30.3
RBFOX2O43251 XAB2-201ENST00000358368 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.734e-8■■■■■ 30.3
RBFOX2O43251 MYO18A-203ENST00000528322 549 ntTSL 414.69□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 30.3
RBFOX2O43251 MYO18A-204ENST00000528564 589 ntTSL 411.75□□□□□ -0.533e-6■■■■■ 30.3
RBFOX2O43251 MYO18A-216ENST00000533420 1168 ntTSL 511.1□□□□□ -0.633e-6■■■■■ 30.3
RBFOX2O43251 MYO18A-221ENST00000590242 637 ntTSL 29.66□□□□□ -0.863e-6■■■■■ 30.3
RBFOX2O43251 MYO18A-219ENST00000585573 319 ntTSL 38.56□□□□□ -1.043e-6■■■■■ 30.3
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RBFOX2O43251 TRAPPC9-203ENST00000517667 518 ntTSL 38.32□□□□□ -1.081e-12■■■■■ 30.2
RBFOX2O43251 TRAPPC9-207ENST00000520532 560 ntTSL 55.86□□□□□ -1.471e-12■■■■■ 30.2
RBFOX2O43251 EIF3G-207ENST00000589009 1522 ntTSL 212.13□□□□□ -0.472e-10■■■■■ 30.2
RBFOX2O43251 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.552e-10■■■■■ 30.2
RBFOX2O43251 EIF3G-206ENST00000588709 828 ntTSL 510.69□□□□□ -0.72e-10■■■■■ 30.2
RBFOX2O43251 EIF3G-202ENST00000587146 709 ntTSL 59.98□□□□□ -0.812e-10■■■■■ 30.2
RBFOX2O43251 EIF3G-213ENST00000593054 453 ntTSL 58.31□□□□□ -1.082e-10■■■■■ 30.2
RBFOX2O43251 EIF3G-208ENST00000589454 873 ntTSL 57.77□□□□□ -1.172e-10■■■■■ 30.2
RBFOX2O43251 ARHGEF16-205ENST00000445297 836 ntTSL 318.45■□□□□ 0.543e-7■■■■■ 30.2
RBFOX2O43251 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.493e-8■■■■■ 30.1
RBFOX2O43251 ZNF428-203ENST00000598676 827 ntTSL 514.89□□□□□ -0.034e-6■■■■■ 30.1
RBFOX2O43251 AL137230.2-201ENST00000555070 452 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.24e-7■■■■■ 30.1
RBFOX2O43251 GSDMD-207ENST00000526469 1643 ntTSL 218.86■□□□□ 0.613e-15■■■■■ 30.1
RBFOX2O43251 GSDMD-205ENST00000526051 700 ntTSL 312.4□□□□□ -0.423e-15■■■■■ 30.1
RBFOX2O43251 GREB1-203ENST00000381483 2347 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.055e-8■■■■■ 30.1
RBFOX2O43251 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.41e-7■■■■■ 30.1
RBFOX2O43251 AC022400.6-202ENST00000603706 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 310.11□□□□□ -0.799e-11■■■■■ 30.1
RBFOX2O43251 NDST2-207ENST00000639645 2448 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.971e-7■■■■■ 30.1
RBFOX2O43251 NDST2-201ENST00000299641 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.021e-7■■■■■ 30.1
RBFOX2O43251 NDST2-202ENST00000309979 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.041e-7■■■■■ 30.1
RBFOX2O43251 NDST2-204ENST00000429742 447 ntTSL 27.97□□□□□ -1.139e-11■■■■■ 30.1
RBFOX2O43251 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.49e-8■■■■■ 30.1
RBFOX2O43251 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.439e-8■■■■■ 30.1
RBFOX2O43251 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.499e-8■■■■■ 30.1
RBFOX2O43251 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.559e-8■■■■■ 30.1
RBFOX2O43251 ATXN1-206ENST00000483591 892 ntTSL 1 (best)6.03□□□□□ -1.443e-8■■■■■ 30
RBFOX2O43251 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.785e-23■■■■■ 30
RBFOX2O43251 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.575e-23■■■■■ 30
RBFOX2O43251 HSF1-202ENST00000527328 2336 ntTSL 214.82□□□□□ -0.045e-23■■■■■ 30
RBFOX2O43251 HSF1-203ENST00000528199 659 ntTSL 512.24□□□□□ -0.455e-23■■■■■ 30
RBFOX2O43251 HSF1-209ENST00000531447 364 ntTSL 210.99□□□□□ -0.655e-23■■■■■ 30
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RBFOX2O43251 USF2-210ENST00000598058 510 ntTSL 216.47■□□□□ 0.232e-16■■■■■ 30
RBFOX2O43251 TULP4-207ENST00000620026 680 ntTSL 416.3■□□□□ 0.21e-8■■■■■ 30
RBFOX2O43251 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.092e-8■■■■■ 30
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RBFOX2O43251 SLC7A2-202ENST00000398090 7557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.12e-8■■■■■ 30
RBFOX2O43251 SLC7A2-201ENST00000004531 7560 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.12e-8■■■■■ 30
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RBFOX2O43251 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.196e-7■■■■■ 29.9
RBFOX2O43251 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.236e-7■■■■■ 29.9
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RBFOX2O43251 ASB13-202ENST00000459912 2780 ntTSL 1 (best)13.75□□□□□ -0.219e-8■■■■■ 29.9
RBFOX2O43251 MAN2C1-235ENST00000567163 1356 ntTSL 517.48■□□□□ 0.391e-8■■■■■ 29.9
RBFOX2O43251 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.21e-8■■■■■ 29.9
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RBFOX2O43251 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.252e-7■■■■■ 29.9
RBFOX2O43251 RELL2-204ENST00000518025 2461 ntTSL 1 (best)15.45■□□□□ 0.062e-7■■■■■ 29.9
RBFOX2O43251 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.032e-7■■■■■ 29.9
RBFOX2O43251 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 29.9
RBFOX2O43251 RELL2-206ENST00000520674 2329 ntTSL 214.14□□□□□ -0.152e-7■■■■■ 29.9
RBFOX2O43251 RELL2-203ENST00000517794 844 ntTSL 313.48□□□□□ -0.252e-7■■■■■ 29.9
RBFOX2O43251 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.133e-7■■■■■ 29.9
RBFOX2O43251 BMP1-213ENST00000521385 2320 ntTSL 1 (best)14.33□□□□□ -0.123e-7■■■■■ 29.9
RBFOX2O43251 BMP1-206ENST00000483364 2362 ntTSL 1 (best)13.93□□□□□ -0.183e-7■■■■■ 29.9
RBFOX2O43251 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.293e-7■■■■■ 29.9
RBFOX2O43251 BMP1-209ENST00000518913 2663 ntTSL 1 (best)12.79□□□□□ -0.363e-7■■■■■ 29.9
RBFOX2O43251 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.413e-7■■■■■ 29.9
RBFOX2O43251 BMP1-215ENST00000522332 1337 ntTSL 1 (best)12.47□□□□□ -0.413e-7■■■■■ 29.9
RBFOX2O43251 BMP1-205ENST00000471755 2695 ntTSL 1 (best)12.29□□□□□ -0.443e-7■■■■■ 29.9
RBFOX2O43251 BMP1-211ENST00000520970 4333 ntTSL 1 (best)12.12□□□□□ -0.473e-7■■■■■ 29.9
RBFOX2O43251 BMP1-210ENST00000520626 3925 ntTSL 1 (best)10.9□□□□□ -0.673e-7■■■■■ 29.9
RBFOX2O43251 BMP1-212ENST00000520982 3244 ntTSL 1 (best)10.82□□□□□ -0.683e-7■■■■■ 29.9
RBFOX2O43251 WNK4-204ENST00000591448 3909 ntTSL 1 (best)10.49□□□□□ -0.732e-11■■■■■ 29.9
RBFOX2O43251 WNK4-201ENST00000246914 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.852e-11■■■■■ 29.9
RBFOX2O43251 ACSL4-209ENST00000505075 390 ntTSL 33.08□□□□□ -1.924e-7■■■■■ 29.9
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RBFOX2O43251 GATC-201ENST00000229384 372 ntTSL 211.28□□□□□ -0.66e-11■■■■■ 29.8
RBFOX2O43251 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.626e-11■■■■■ 29.8
RBFOX2O43251 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.646e-11■■■■■ 29.8
RBFOX2O43251 DNM2-222ENST00000593220 561 ntTSL 310.91□□□□□ -0.662e-8■■■■■ 29.8
RBFOX2O43251 GNB1-207ENST00000472614 708 ntTSL 217.98■□□□□ 0.472e-10■■■■■ 29.8
RBFOX2O43251 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.622e-10■■■■■ 29.8
RBFOX2O43251 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.832e-10■■■■■ 29.8
RBFOX2O43251 MED25-204ENST00000593636 1012 ntTSL 213.59□□□□□ -0.233e-8■■■■■ 29.8
RBFOX2O43251 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.219e-10■■■■■ 29.7
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