Protein–RNA interactions for Protein: O43236

SEPT4, Septin-4, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT4O43236 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEPT4O43236 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEPT4O43236 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SEPT4O43236 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEPT4O43236 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEPT4O43236 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEPT4O43236 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEPT4O43236 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEPT4O43236 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEPT4O43236 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEPT4O43236 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEPT4O43236 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEPT4O43236 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEPT4O43236 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEPT4O43236 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEPT4O43236 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEPT4O43236 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEPT4O43236 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEPT4O43236 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEPT4O43236 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
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