Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms