Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD28O15084 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD28O15084 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD28O15084 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD28O15084 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD28O15084 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD28O15084 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD28O15084 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD28O15084 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD28O15084 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD28O15084 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD28O15084 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD28O15084 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD28O15084 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD28O15084 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD28O15084 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD28O15084 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD28O15084 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD28O15084 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD28O15084 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD28O15084 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD28O15084 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD28O15084 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD28O15084 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD28O15084 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD28O15084 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD28O15084 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD28O15084 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD28O15084 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD28O15084 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD28O15084 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD28O15084 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD28O15084 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD28O15084 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD28O15084 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD28O15084 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD28O15084 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD28O15084 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD28O15084 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD28O15084 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD28O15084 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD28O15084 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD28O15084 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD28O15084 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD28O15084 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD28O15084 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD28O15084 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD28O15084 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD28O15084 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD28O15084 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD28O15084 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD28O15084 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD28O15084 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD28O15084 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD28O15084 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD28O15084 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD28O15084 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD28O15084 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD28O15084 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD28O15084 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms