Protein–RNA interactions for Protein: O15075

DCLK1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK1O15075 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCLK1O15075 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms