Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCF2LO15068 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCF2LO15068 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCF2LO15068 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms