Protein–RNA interactions for Protein: O15034

RIMBP2, RIMS-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP2O15034 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RIMBP2O15034 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RIMBP2O15034 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RIMBP2O15034 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RIMBP2O15034 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RIMBP2O15034 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RIMBP2O15034 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RIMBP2O15034 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RIMBP2O15034 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RIMBP2O15034 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RIMBP2O15034 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RIMBP2O15034 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RIMBP2O15034 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RIMBP2O15034 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RIMBP2O15034 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RIMBP2O15034 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RIMBP2O15034 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RIMBP2O15034 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RIMBP2O15034 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RIMBP2O15034 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RIMBP2O15034 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RIMBP2O15034 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RIMBP2O15034 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RIMBP2O15034 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RIMBP2O15034 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RIMBP2O15034 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RIMBP2O15034 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RIMBP2O15034 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms