Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTDSP2O14595 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTDSP2O14595 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTDSP2O14595 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTDSP2O14595 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTDSP2O14595 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTDSP2O14595 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTDSP2O14595 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTDSP2O14595 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTDSP2O14595 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTDSP2O14595 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSP2O14595 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSP2O14595 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSP2O14595 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSP2O14595 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSP2O14595 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSP2O14595 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSP2O14595 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSP2O14595 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSP2O14595 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSP2O14595 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSP2O14595 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSP2O14595 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSP2O14595 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSP2O14595 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSP2O14595 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSP2O14595 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSP2O14595 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSP2O14595 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSP2O14595 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSP2O14595 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSP2O14595 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSP2O14595 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSP2O14595 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSP2O14595 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSP2O14595 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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