Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM38O00635 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms