Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PODXLO00592 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PODXLO00592 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PODXLO00592 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PODXLO00592 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PODXLO00592 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PODXLO00592 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PODXLO00592 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PODXLO00592 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PODXLO00592 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PODXLO00592 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PODXLO00592 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PODXLO00592 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PODXLO00592 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PODXLO00592 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PODXLO00592 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PODXLO00592 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PODXLO00592 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PODXLO00592 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PODXLO00592 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PODXLO00592 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PODXLO00592 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PODXLO00592 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PODXLO00592 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PODXLO00592 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PODXLO00592 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PODXLO00592 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PODXLO00592 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PODXLO00592 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PODXLO00592 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PODXLO00592 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PODXLO00592 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PODXLO00592 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PODXLO00592 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PODXLO00592 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PODXLO00592 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PODXLO00592 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PODXLO00592 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PODXLO00592 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PODXLO00592 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PODXLO00592 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PODXLO00592 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PODXLO00592 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PODXLO00592 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PODXLO00592 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PODXLO00592 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PODXLO00592 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PODXLO00592 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PODXLO00592 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PODXLO00592 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PODXLO00592 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PODXLO00592 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PODXLO00592 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PODXLO00592 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PODXLO00592 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PODXLO00592 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PODXLO00592 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PODXLO00592 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PODXLO00592 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PODXLO00592 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PODXLO00592 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PODXLO00592 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PODXLO00592 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PODXLO00592 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PODXLO00592 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PODXLO00592 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PODXLO00592 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PODXLO00592 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PODXLO00592 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PODXLO00592 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PODXLO00592 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PODXLO00592 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PODXLO00592 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PODXLO00592 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PODXLO00592 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PODXLO00592 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PODXLO00592 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PODXLO00592 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PODXLO00592 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PODXLO00592 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PODXLO00592 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PODXLO00592 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PODXLO00592 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PODXLO00592 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PODXLO00592 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PODXLO00592 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PODXLO00592 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PODXLO00592 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PODXLO00592 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PODXLO00592 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PODXLO00592 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PODXLO00592 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PODXLO00592 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PODXLO00592 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PODXLO00592 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PODXLO00592 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PODXLO00592 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PODXLO00592 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PODXLO00592 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PODXLO00592 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms