Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBAG9O00559 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms