Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms