Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms