Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KT08 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KT08 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KT08 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KT08 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KT08 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KT08 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KT08 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KT08 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KT08 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KT08 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KT08 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KT08 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KT08 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KT08 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KT08 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KT08 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KT08 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KT08 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KT08 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KT08 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KT08 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KT08 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KT08 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KT08 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KT08 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KT08 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KT08 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KT08 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KT08 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
J3KT08 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
J3KT08 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
J3KT08 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
J3KT08 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
J3KT08 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
J3KT08 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
J3KT08 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
J3KT08 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
J3KT08 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
J3KT08 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
J3KT08 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
J3KT08 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
J3KT08 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
J3KT08 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
J3KT08 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
J3KT08 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
J3KT08 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
J3KT08 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
J3KT08 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
J3KT08 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
J3KT08 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
J3KT08 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
J3KT08 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
J3KT08 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
J3KT08 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
J3KT08 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
J3KT08 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
J3KT08 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
J3KT08 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
J3KT08 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
J3KT08 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
J3KT08 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KT08 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KT08 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KT08 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KT08 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KT08 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KT08 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KT08 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KT08 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KT08 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KT08 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KT08 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KT08 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KT08 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KT08 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KT08 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KT08 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KT08 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KT08 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KT08 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KT08 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KT08 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KT08 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KT08 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KT08 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KT08 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KT08 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KT08 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KT08 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KT08 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KT08 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KT08 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KT08 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KT08 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KT08 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KT08 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KT08 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KT08 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KT08 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms