Protein–RNA interactions for Protein: H7C1W4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1W4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
H7C1W4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
H7C1W4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
H7C1W4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
H7C1W4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
H7C1W4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
H7C1W4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
H7C1W4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
H7C1W4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
H7C1W4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
H7C1W4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
H7C1W4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
H7C1W4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
H7C1W4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
H7C1W4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
H7C1W4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
H7C1W4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
H7C1W4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
H7C1W4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
H7C1W4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
H7C1W4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
H7C1W4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
H7C1W4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
H7C1W4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
H7C1W4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
H7C1W4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
H7C1W4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
H7C1W4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
H7C1W4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
H7C1W4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
H7C1W4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
H7C1W4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
H7C1W4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
H7C1W4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
H7C1W4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
H7C1W4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
H7C1W4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
H7C1W4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
H7C1W4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
H7C1W4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
H7C1W4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
H7C1W4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
H7C1W4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
H7C1W4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
H7C1W4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
H7C1W4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
H7C1W4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
H7C1W4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
H7C1W4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
H7C1W4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
H7C1W4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
H7C1W4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
H7C1W4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
H7C1W4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
H7C1W4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
H7C1W4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
H7C1W4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
H7C1W4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
H7C1W4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
H7C1W4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
H7C1W4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
H7C1W4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
H7C1W4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
H7C1W4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
H7C1W4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
H7C1W4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
H7C1W4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
H7C1W4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
H7C1W4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
H7C1W4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
H7C1W4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
H7C1W4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
H7C1W4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
H7C1W4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
H7C1W4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
H7C1W4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
H7C1W4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
H7C1W4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
H7C1W4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
H7C1W4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
H7C1W4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
H7C1W4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
H7C1W4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
H7C1W4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
H7C1W4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
H7C1W4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
H7C1W4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
H7C1W4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
H7C1W4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
H7C1W4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
H7C1W4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
H7C1W4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
H7C1W4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
H7C1W4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
H7C1W4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
H7C1W4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
H7C1W4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
H7C1W4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
H7C1W4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
H7C1W4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms