Protein–RNA interactions for Protein: H3BU86

STX16-NPEPL1, STX16-NPEPL1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
STX16-NPEPL1H3BU86 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
STX16-NPEPL1H3BU86 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
STX16-NPEPL1H3BU86 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
STX16-NPEPL1H3BU86 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
STX16-NPEPL1H3BU86 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STX16-NPEPL1H3BU86 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STX16-NPEPL1H3BU86 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STX16-NPEPL1H3BU86 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STX16-NPEPL1H3BU86 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
STX16-NPEPL1H3BU86 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
STX16-NPEPL1H3BU86 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
STX16-NPEPL1H3BU86 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
STX16-NPEPL1H3BU86 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
STX16-NPEPL1H3BU86 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
STX16-NPEPL1H3BU86 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
STX16-NPEPL1H3BU86 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
STX16-NPEPL1H3BU86 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
STX16-NPEPL1H3BU86 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
STX16-NPEPL1H3BU86 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STX16-NPEPL1H3BU86 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
STX16-NPEPL1H3BU86 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms