Protein–RNA interactions for Protein: F2Z398

LMO7DN, LMO7 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7DNF2Z398 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMO7DNF2Z398 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms