Protein–RNA interactions for Protein: B9A030

TISP43, Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TISP43B9A030 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TISP43B9A030 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TISP43B9A030 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms