Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRDCB7Z8K6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms