Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms