Protein–RNA interactions for Protein: A6NGE7

URAD, Putative 2-oxo-4-hydroxy-4-carboxy-5-ureidoimidazoline decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URADA6NGE7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
URADA6NGE7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
URADA6NGE7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
URADA6NGE7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
URADA6NGE7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
URADA6NGE7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
URADA6NGE7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
URADA6NGE7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
URADA6NGE7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
URADA6NGE7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
URADA6NGE7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
URADA6NGE7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
URADA6NGE7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
URADA6NGE7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
URADA6NGE7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
URADA6NGE7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
URADA6NGE7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
URADA6NGE7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
URADA6NGE7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
URADA6NGE7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
URADA6NGE7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
URADA6NGE7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
URADA6NGE7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
URADA6NGE7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
URADA6NGE7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
URADA6NGE7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
URADA6NGE7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
URADA6NGE7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
URADA6NGE7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
URADA6NGE7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
URADA6NGE7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
URADA6NGE7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
URADA6NGE7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
URADA6NGE7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
URADA6NGE7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms