Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GOLGA6CA6NDK9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms