Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PSDA5PKW4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PSDA5PKW4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PSDA5PKW4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PSDA5PKW4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PSDA5PKW4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PSDA5PKW4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PSDA5PKW4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSDA5PKW4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSDA5PKW4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSDA5PKW4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSDA5PKW4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSDA5PKW4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PSDA5PKW4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PSDA5PKW4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PSDA5PKW4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PSDA5PKW4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PSDA5PKW4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PSDA5PKW4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PSDA5PKW4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PSDA5PKW4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PSDA5PKW4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PSDA5PKW4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PSDA5PKW4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PSDA5PKW4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PSDA5PKW4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PSDA5PKW4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PSDA5PKW4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PSDA5PKW4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PSDA5PKW4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PSDA5PKW4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSDA5PKW4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSDA5PKW4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSDA5PKW4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSDA5PKW4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSDA5PKW4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSDA5PKW4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PSDA5PKW4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSDA5PKW4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PSDA5PKW4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PSDA5PKW4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PSDA5PKW4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PSDA5PKW4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PSDA5PKW4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PSDA5PKW4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PSDA5PKW4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PSDA5PKW4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PSDA5PKW4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PSDA5PKW4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PSDA5PKW4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PSDA5PKW4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PSDA5PKW4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PSDA5PKW4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PSDA5PKW4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSDA5PKW4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PSDA5PKW4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSDA5PKW4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PSDA5PKW4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PSDA5PKW4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PSDA5PKW4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PSDA5PKW4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PSDA5PKW4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PSDA5PKW4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PSDA5PKW4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PSDA5PKW4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PSDA5PKW4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PSDA5PKW4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PSDA5PKW4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PSDA5PKW4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PSDA5PKW4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PSDA5PKW4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PSDA5PKW4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PSDA5PKW4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PSDA5PKW4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSDA5PKW4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSDA5PKW4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSDA5PKW4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSDA5PKW4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSDA5PKW4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PSDA5PKW4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PSDA5PKW4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PSDA5PKW4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PSDA5PKW4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PSDA5PKW4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PSDA5PKW4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PSDA5PKW4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PSDA5PKW4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSDA5PKW4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSDA5PKW4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSDA5PKW4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSDA5PKW4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSDA5PKW4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSDA5PKW4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PSDA5PKW4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms