Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FRMD3A2A2Y4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms