Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPC1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPC1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
A0A1W2PPC1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1W2PPC1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms