Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRI6

CENPVL3, Centromere protein V-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPVL3A0A0U1RRI6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPVL3A0A0U1RRI6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms