Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X0T9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X0T9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.6 ms