Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 AC023509.3-202ENST00000591834 1609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 SPG20-AS1-203ENST00000493739 566 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 NMNAT3-212ENST00000511444 873 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 TRPC5OS-203ENST00000635763 955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 HLA-DQA1-201ENST00000343139 1591 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 CKS2-201ENST00000314355 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 OR2V2-201ENST00000328275 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 NAT8B-201ENST00000377712 765 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 KRTAP12-1-201ENST00000391617 588 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 SNORA50D-201ENST00000408059 134 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 NOS2P3-201ENST00000411468 867 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 AP001331.1-201ENST00000413008 1015 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 NOS2P2-201ENST00000426269 867 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 CST7-201ENST00000480798 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 RN7SL638P-201ENST00000494527 290 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 AC078923.1-201ENST00000552856 748 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 AC026150.1-201ENST00000562992 701 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 AL078624.1-201ENST00000604004 547 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 AC009812.1-201ENST00000605948 1059 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 AC018904.2-201ENST00000561202 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 GOLGA8G-203ENST00000525590 2009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 GOLGA8F-202ENST00000532622 2009 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms