Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms