Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP4P49662 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP4P49662 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP4P49662 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP4P49662 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP4P49662 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP4P49662 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP4P49662 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP4P49662 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP4P49662 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP4P49662 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP4P49662 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP4P49662 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP4P49662 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP4P49662 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP4P49662 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP4P49662 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP4P49662 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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CASP4P49662 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASP4P49662 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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CASP4P49662 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CASP4P49662 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CASP4P49662 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CASP4P49662 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CASP4P49662 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CASP4P49662 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CASP4P49662 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CASP4P49662 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CASP4P49662 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CASP4P49662 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CASP4P49662 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CASP4P49662 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CASP4P49662 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CASP4P49662 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CASP4P49662 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CASP4P49662 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CASP4P49662 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CASP4P49662 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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