Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NESP48681 HMBS-202ENST00000392841 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NESP48681 TEX101-203ENST00000602198 1446 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NESP48681 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NESP48681 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NESP48681 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NESP48681 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NESP48681 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NESP48681 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NESP48681 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NESP48681 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NESP48681 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NESP48681 IFT43-202ENST00000314067 833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NESP48681 SNORA80B-201ENST00000383906 136 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NESP48681 PYY3-201ENST00000419078 213 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NESP48681 COQ5-202ENST00000445328 992 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NESP48681 LINC00877-202ENST00000464271 552 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NESP48681 MIOXP1-201ENST00000521205 835 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NESP48681 OR52P2P-201ENST00000527287 955 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NESP48681 MYO5BP1-201ENST00000610994 1239 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NESP48681 AC012442.3-201ENST00000636053 940 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NESP48681 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NESP48681 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NESP48681 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NESP48681 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NESP48681 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NESP48681 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NESP48681 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NESP48681 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NESP48681 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NESP48681 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NESP48681 GHRL-201ENST00000287656 1313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NESP48681 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NESP48681 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NESP48681 AK4P5-201ENST00000404520 634 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NESP48681 AC024028.1-201ENST00000437145 437 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NESP48681 C3orf35-206ENST00000452017 513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NESP48681 HOPX-209ENST00000508121 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NESP48681 ODF3-203ENST00000525282 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NESP48681 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NESP48681 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NESP48681 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NESP48681 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NESP48681 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NESP48681 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NESP48681 C8orf86-202ENST00000437935 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NESP48681 RAE1-209ENST00000527947 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NESP48681 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NESP48681 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NESP48681 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NESP48681 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NESP48681 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NESP48681 DAP3-203ENST00000421487 1470 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NESP48681 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NESP48681 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NESP48681 MBD3L2-201ENST00000381393 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NESP48681 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NESP48681 HLA-DRB9-201ENST00000449413 343 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NESP48681 AC103740.2-201ENST00000557900 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NESP48681 CASC15-202ENST00000561912 1449 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NESP48681 AC009034.1-201ENST00000568125 669 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NESP48681 AC091588.2-201ENST00000578741 366 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NESP48681 SH3GL1P2-201ENST00000582245 1082 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NESP48681 AC011444.2-201ENST00000587759 567 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NESP48681 CLPP-204ENST00000596149 745 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NESP48681 C5orf60-208ENST00000625191 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NESP48681 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NESP48681 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NESP48681 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NESP48681 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NESP48681 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NESP48681 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NESP48681 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NESP48681 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NESP48681 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NESP48681 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NESP48681 RGS6-202ENST00000355512 1564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NESP48681 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NESP48681 CRYBB2-201ENST00000398215 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NESP48681 CYTOR-202ENST00000409054 1096 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NESP48681 HNRNPA1P46-201ENST00000411735 937 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NESP48681 AC073316.2-201ENST00000414126 418 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NESP48681 RPL7AP53-201ENST00000468834 793 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NESP48681 KRT19P3-201ENST00000507547 828 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NESP48681 ZBTB25-203ENST00000555424 565 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NESP48681 AC021439.1-201ENST00000562975 591 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NESP48681 AC011773.4-202ENST00000566000 1264 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NESP48681 AC069366.2-201ENST00000583643 430 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NESP48681 AC015688.5-201ENST00000584605 603 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NESP48681 UROD-221ENST00000636293 1102 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NESP48681 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NESP48681 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NESP48681 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NESP48681 PADI6-201ENST00000619609 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NESP48681 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NESP48681 DNASE1L3-207ENST00000486455 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NESP48681 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NESP48681 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NESP48681 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NESP48681 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms