Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms