Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms