Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 ABLIM3-211ENST00000517451 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 GREM2-201ENST00000318160 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 POLR3E-201ENST00000299853 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 ATP2C1-221ENST00000513801 3439 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 PLEKHG5-205ENST00000377740 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 PCDHGB2-201ENST00000522605 4602 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 PCDHAC1-201ENST00000253807 5299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 CYP4F11-201ENST00000248041 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 OPRK1-206ENST00000613482 4682 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 NOL4L-203ENST00000359676 5991 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 POLR1B-201ENST00000263331 4558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 PIGC-202ENST00000367728 2630 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AP002008.2-201ENST00000635926 4870 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 TMEM86A-201ENST00000280734 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 SLC44A4-202ENST00000229729 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 LMX1A-202ENST00000342310 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 LRTM2-208ENST00000543818 3986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 WWP2-202ENST00000359154 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 OVOL1-201ENST00000335987 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 SLC5A10-201ENST00000317977 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 PPP4R1-202ENST00000400555 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 FAM177A1-201ENST00000280987 2927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 PLAT-202ENST00000352041 2516 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 SUN2-202ENST00000405510 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 SYDE1-203ENST00000600252 3832 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
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